En este apartado, además de presentar las líneas de investigación actuales y/o recientes, se mencionan también al final las líneas de investigación antiguas en las que ya no trabajamos en la actualidad. Para cada línea de investigación se especifican las principales especies utilizadas como modelo y las zonas de estudio que pueden consultarse en detalle en “Especies y zonas de estudio”.

Coevolución

1. Carreras de armamentos entre parásitos de cría y sus hospedadores:
   1. Relaciones coevolutivas entre el cuco común y sus especies hospedadoras en Europa. (Especies modelo: Cuco común, alzacola, petirrojo, mosquitero papialbo, mirlo común; Zonas de estudio: Los Palacios (Sevilla), Parque Nacional de Sierra Nevada y Valle de Lecrín).
   2. Relaciones coevolutivas entre el críalo europeo y sus hospedadores. (Especies modelo: Críalo europeo, urraca y corneja negra; Zonas de estudio: Principalmente la Hoya de Guadix (Granada), aunque se han realizado estudios en 18 zonas repartidas por toda Europa).
   3. Reconocimiento de huevos en un parásito de cría intraespecífico: el gorrión común. (Especies modelo: Gorrión común; Zona de estudio: Aviario de la Facultad de Ciencias).
   4. Mecanismos involucrados en la evolución del reconocimiento y expulsión de huevos por parte de las especies hospedadoras. (Especies modelo: Mirlo común y gorrión común; Zonas de estudio: Valle de Lecrín y aviario de la Facultad de Ciencias).
   5. Papel del riesgo de depredación en el reconocimiento y expulsión de huevos parásitos. (Especies modelo: Mirlo común y mosquitero papialbo; Zona de estudio: Valle de Lecrín y Parque Nacional de Sierra Nevada).
   6. Papel de las hormonas en el reconocimiento y expulsión de huevos parásitos (Especies modelo: Mirlo común y mosquitero papialbo; Zonas de estudio: Valle de Lecrín y Parque Nacional de Sierra Nevada).
2. Simbiosis mutualistas entre aves y bacterias: Relaciones entre aves y las bacterias que algunas especies albergan en su glándula uropigial que pueden ayudarles en la defensa frente a patógenos. (Especies modelo: Principalmente la abubilla, pero en general, aves nidícolas y bacterias; Zonas de estudio: Hoya de Guadix, y aviario de la Facultad de Ciencias).

Parasitismo de cría

1. Dimorfismo sexual en el críalo europeo. (Especie modelo: Críalo europeo; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
2.  Mimetismo y adaptación de la petición de alimento del críalo europeo en sus dos principales especies hospedadoras. (Especies modelo: Críalo europeo, urraca y corneja negra; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
3. Adaptaciones al parasitismo a nivel de sistema digestivo en los pollos de críalo. (Especies modelo: Críalo europeo, urraca y corneja negra; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
4. Neurobiología del aprendizaje del grito de petición de alimento en aves. (Especies modelo: Críalo europeo, urraca y corneja negra; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
5. Rutas de migración e invernada y mortalidad del críalo europeo durante sus migraciones mediante la utilización de geolocalizadores y radiotransmisores vía satélite. (Especie modelo: Críalo europeo; Zonas de estudio: Hoya de Guadix (Granada) y Senegal).
6. Reconocimiento de huevos en dos especies hospedadoras del críalo en África. (Especies modelo: Cuervo blanco, estornino bicolor; Zonas de estudio: Senegal).

Estrategias reproductivas en aves

1. Cría cooperativa: Estudio de la presencia de ayudantes en el nido y su influencia en el parasitismo de cría. (Especie modelo: Corneja negra; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
2. Fisiología del comportamiento: Relación entre los niveles hormonales y el comportamiento petitorio de los pollos en aves. (Especies modelo: Mirlo común y Gorrión común; Zonas de estudio: Parque Natural de Sierra Nevada, área urbana de Granada, Valle de Lecrín y aviario de la Facultad de Ciencias).
3. Influencia de la depredación de nidos en el comportamiento de las aves: Adaptaciones de las aves en fase de pollo y adulto a la presión por depredación de nidos. (Especie modelo: Mirlo común; Zonas de estudio: Parque Natural de Sierra Nevada, área urbana de Granada y Valle de Lecrín.
4. Sistemas de apareamiento y selección sexual: Determinación de los patrones de apareamiento y éxito reproductor individual usando marcadores genéticos, estudio de la evolución de señales sexuales y competencia espermática. Especies modelo: Críalo europeo, urraca y abubilla). Zona de estudio: Hoya de Guadix).
5. Biología reproductiva del mosquitero papialbo. (Especie modelo: Mosquitero papialbo; Zona de estudio: Parque Natural de Sierra Nevada).

Evolución de señales

1. Comportamiento petitorio: Adaptaciones surgidas en pollos de aves parásitas de cría para explotar eficazmente a sus hospedadores. (Especies modelo: Alzacola, críalo europeo, urraca, gorrión común; Zonas de estudio: Hoya de Guadix, Los Palacios y aviario de la Facultad de Ciencias).
2. Selección sexual: Significado y la explicación evolutiva de las señales sexuales sonoras (cantos) y visuales (colores y ornamentos) exhibidas por los animales. (Especies modelo: Aves en general; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
3. Señales aposemáticas: Función de la coloración en las aves coraciiformes como señales aposemáticas que avisan sobre defensas químicas o de otro tipo frente a depredadores. (Especies modelo: Aves coraciformes; Zona de estudio: Parque Nacional de Doñana Sevilla).

Líneas de investigación antiguas

1. Biología reproductiva de la grajilla. (Especie modelo: Grajilla; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
2. Selección sexual y biología reproductiva de la collalba negra. (Especie modelo: Collalba negra; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
3. Coevolución entre la procesionaria del pino y los pinos de los que se alimentan sus larvas. (Especie modelo: Procesionaria del pino; Zona de estudio: Hoya de Guadix).
4. Biología reproductiva del alzacola. (Especie modelo: Alzacola; Zona de estudio: Los palacios).
5. Sistemas defensivos frente a parásitos, ecología evolutiva del sistema inmune. (Especies modelo: Aves en general; Zonas de estudio: Hoya de Guadix, Parque Nacional de Sierra Nevada).
6. Estrategias reproductivas en el pingüino barbijo. (Especie modelo: Pingüino barbijo; Zona de estudio: Isla Decepción).